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常见实验菌株均可操作 | 基因敲除 | 基因敲入 | 定点突变
大肠杆菌是重要的模式生物,也是工业发酵、重组蛋白表达与合成生物学研究中最常用的底盘菌株。英茂盛业成熟掌握多种大肠杆菌基因编辑技术,可为客户提供大肠杆菌基因敲除、基因敲入、定点突变等全方位大肠杆菌基因编辑服务。
我们的编辑方案适用于常见实验菌株与工业菌株,如 DH5α、TOP10、JM109、HB101、BL21(DE3)、Rosetta(DE3)、MG1655、K-12、W3110、BW25113 等;客户自备的特殊菌株,我们也可评估后制定专属方案。如需 Nissle 1917(EcN)益生菌底盘编辑,请前往Nissle 1917 基因编辑页面。
★ 服务亮点:技术核心包括 λ-Red 同源重组、CRISPR/Cas9、iStop 碱基编辑三种方案,覆盖常规敲除、无痕编辑与低成本快周期需求;编辑完成后提供 PCR 鉴定与测序验证,确保交付菌株基因型准确。
以下常见实验菌株均可进行基因编辑(如需其他菌株请先咨询确认方案兼容性):
| 菌株 | 背景特点 | 适用编辑类型 |
|---|---|---|
| DH5α / TOP10 | 常规克隆宿主 | 敲除、敲入、定点突变 |
| JM109 / HB101 | 常规克隆宿主 | 敲除、敲入、定点突变 |
| BL21(DE3) | 蛋白表达宿主 | 敲除、敲入、定点突变 |
| Rosetta(DE3) | 补充稀有密码子 | 敲除、敲入、定点突变 |
| MG1655 / K-12 / W3110 | 模式菌株 | 敲除、敲入、定点突变 |
| BW25113 | Keio 敲除库背景 | 敲除、敲入、定点突变 |
| Nissle 1917 | 益生菌底盘(专项服务) | 敲除、敲入、定点突变 |
| 其他自备菌株 | 客户提供菌株与背景信息 | 评估后定制方案 |
针对不同的编辑需求,我们提供三种成熟的技术方案,您可根据目标与预算选择,也可由我们的技术团队推荐:
Red 同源重组系统来自 lambda 噬菌体,在 pKD46 载体表达 Gam、Exo、Beta 三个蛋白,实现将外源 DNA 同源重组到大肠杆菌基因组。该系统成熟高效,可以实现基因敲入、敲除。我们在 Red 重组系统的基础上加入 Cre-loxP 系统对插入的筛选抗性基因进行清除,基本实现无痕编辑。
服务周期:4-5 周
服务价格:询价
应用范围:基因敲入、基因敲除
CRISPR/Cas9 定点切割基因组 DNA,然后由 Red 重组酶进行修复。未能修复成功的大肠杆菌因基因组 DNA 断裂死亡,修复成功的个体即编辑成功的个体得以存活。CRISPR/Cas9 系统可以真正做到无痕基因编辑;与 Red 同源重组相比,其独特的无标签筛选阳性克隆机制,在进行需要很高精确度的定点突变中优势明显。
服务周期:5-6 周
服务价格:询价
应用范围:基因敲除、定点突变
iStop 技术是 CRISPR CBE(碱基编辑)技术的应用。该技术不需要对 DNA 进行双链切割,也不会导致菌体死亡。通过 sgRNA 将碱基编辑酶引导到大肠杆菌基因组的特定位置,造成该靶点位置的 C>T 突变,从而将 CAA、CGA、CAG 等数个密码子突变为终止密码子,导致基因翻译的提前终止,实现基因功能缺失。
该技术对基因组仅进行极小的改动,对生物体的干扰非常小,且无需重组模板,构建周期短、成本较低。
服务周期:3-4 周
服务价格:询价
应用范围:基因敲除
| 对比项目 | Red 同源重组 | CRISPR/Cas9 | iStop 碱基编辑 |
|---|---|---|---|
| 原理 | λ-Red 重组 + Cre-loxP 清抗性 | Cas9 切割 + Red 修复 | CBE 碱基编辑(C>T) |
| 是否无痕 | 基本无痕 | 完全无痕 | 完全无痕 |
| 是否切割双链 | 否 | 是 | 否 |
| 是否需要重组模板 | 需要 | 需要 | 不需要 |
| 服务周期 | 4-5 周 | 5-6 周 | 3-4 周 |
| 成本 | 较低 | 中等 | 较低 |
| 推荐应用场景 | 常规敲除、敲入 | 高精度定点突变、无痕编辑 | 快速低成本敲除 |
为了项目顺利开展,请在送样或下单时提供以下信息:
菌株名称与菌株号:如 DH5α、BL21(DE3)、MG1655 等
基因型背景:如已知的基因型、表型或特殊修饰系统
菌株来源:自备菌株请提供纯化甘油菌或新鲜平板,并注明培养条件与温度
抗性背景:菌株携带的抗生素抗性标记(避免与筛选标记冲突)
基因名称与功能:目标基因的名称、功能注释
基因序列:提供基因序列或 NCBI 登录号(Accession Number)
基因组信息:如为特殊菌株,建议提供基因组序列或参考菌株信息
编辑类型:基因敲除 / 基因敲入 / 定点突变 / 多基因编辑
目标位点:如已有目标位点、重组臂或 sgRNA 设计请一并提供;没有则由我们免费设计并出具方案
敲入内容:敲入的基因或片段序列、表达元件要求(启动子、标签等)
特殊要求:无痕编辑要求、交付形式(甘油菌/平板)、加急需求
★ 温馨提示:信息不完整的项目,我们的技术人员会在启动前与您逐一确认,确保方案可行后再开工。
需求沟通
方案设计
签订合同
项目启动
载体构建
sgRNA 设计
转化编辑
阳性筛选
基因型验证
测序确认
菌株交付
售后支持
编辑成功的菌株:2-3 管甘油菌保存
实验报告:详细的实验操作流程和结果分析
验证数据:PCR 鉴定电泳图、测序验证峰图和序列比对结果
菌株信息:完整的基因型说明和培养建议
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如有任何关于大肠杆菌基因编辑服务的疑问,欢迎随时联系我们,技术团队将为您提供专业的咨询与定制化方案。